結論：「妊娠をしたことなどを理由に、女性労働者を解雇や不利益な取り扱いをしてはならない」（雇用機会均等法）、但し、妊娠を理由ではなく、あくまでも契約更新基準に沿っての決定であれば契約期間満了は可能となります。

補足：契約更新をしない利用を妊娠以外で証明できれば大丈夫です。基本はトラブルに発展しないように従業員と話し合い理解を得ましょう。